Популяционный иммунитет и круизный лайнер

Наглядно о том, какой % вакцинации населения нужен, чтобы остановить эпидемию ковида.
На днях из Техаса отправился в круиз лайнер Карнавал, на борту которого: 3000 пассажиров, привитых на 96.5% (а остальные поднялись на борт с негативными тестами, тк  для детей обязательной прививки нет, и еще лайнер делал исключения для людей с "медицинскими показаниями  от прививки" (аллергия,этс)) и 1400 экипажа-персонала, привитые на 99.98%  (и 0.02% с отрицательным тестом).
Не успел лайнер доплыть до своей первой остановки в Белизе ( в среду)- как на борту оказалось 27 человек с ковидом.
Симптомы, у кого есть- легкие, а у некоторых, и нет симптомов. Все 27 с положительными тестами на ковид- полностью привиты.
27 человек -это около 0.7% от выборки, мало, но  этот % выскочил, как чертик из коробочки, среди популяции привитых (в среднем, более чем на 97%), в первую же неделю.
Конечно, ввиду того, что там контингент привитых, а прививка защищает "от тяжести болезни и от смерти", скорее всего, все обойдется. Тем более, что уверяют, что всех регулярно тестируют и всех положительных- изолировали, чтоб ограничить распространение.
Однако, этот случая показывает, что привитость 99%  (команда, среди которой 26 привитых стали положительными) - не является препятствием для распространения вируса, для прекращения эпидемии, сама по себе.
( Read more... )

Монголы четко подошли

Вот, достаточно стройный подход к выяснению причин ситуации с пробоями ковида.
В Монголии (3.3 млн жителей) начали прививать, как и везде, но темпы были не самые быстрые, а и вакцины- всякие.
Случаи ковида росли, потому весной устроили локдаун. Прививать продолжали, так что в мае было уже выше 57% привитых хотя бы 1 дозой в популяции,и 40% полностью,и локдаун вроде бы сработал, все снизилось. Меры сняли. И снова в июне вверх пошли случаи ковида, да как на дрожжах (1-2.5 тыс случаев в день, на пике 3 тыс).
Авторы статьи отмечают, что заболевали как непривитые, так и привитые.
Решив выснить, в чем тут дело (слабо ли работают вакцины и какие, или может  устойчивый штамм гуляет), исследователи взяли, да и проверили: что там с антителами у привитых, но не заразившихся (здоровый привитый контроль), ну и, что же за штамм заразил привитых (полная прочитка генома вируса).
 Не удивительно, что это был  не оригинальный уханьский штамм, а те, что уже гуляли и в других частях мира.
95% пробоев- вариант "альфа" (пошел гулять по миру осенью-зимой). Остальные 5%- вариант "дельта".
Что же по связи случаев пробоев с тем, какой вакциной прививали.
Среди пробоев с вариантом "альфа", 62.1% из пробоев было после прививки  Sinopharm,  26.4% после Covishield/AZN,  8.0%  после прививки Sputnik V,  и 3.4% после прививки Pfizer/BioNTech.
В случае с вариантом "дельта" (5 случаев), 60% после Covishield/AZN,  и по 20% из пробоев было после прививки  Sinopharm,  и Pfizer/BioNTech.
Анализ титров антител к шипиковому белку коронавируса показал, что среди привитых разными вакцинами, больше всего серопозитивность была у привитых Pfizer/BioNTech (91.6%), потом,  Covishield/AstraZeneca (70.8%), затем,  Sputnik V (29.2%), и в хвосте- Sinopharm (12.5%).
Так же, когда проверили антитела на белок нуклеокапсида у здоровых,  "контрольных" привитых,  то только у 12% привитых Sinopharm  оказались в крови антитела. Это логично (тк только эта вакцина из проверяемых содержит инактивированнй вирус). Обнаружились случаи среди привитых Covishield/AstraZeneca- и, тк вакцины не содержали нуклеокапсидных генов- то был либо асимптоматичный пробой, либо предыдыдущая асимптоматичная инфекция.
Любопытно, что 4 человека получили смешанную прививку- 2 дозы Sinopharm , третья Pfizer/BioNTech. У них обнаружились антитела только к шипику, у 75%.
Сыворотку крови контрольных привитых так же проверили на нейтрализующую активность к вариантам коронавируса "альфа" и "дельта"
У тех, кто был привит  Pfizer/BioNTech- нейтрализующий эффект был в 79.7%, для  Covishield/AstraZeneca - 50.0%, для Sputnik V  нейтрализующая активность для "альфы" была 25.0%, и хуже всех справился Sinopharm (20.8%).
По "дельте" защитный эффект  прививки был слабее, и выглядел так: 29.2% - для привитых Pfizer/BioNTech, 25% - для Covishield/AZN, 12,5% для Sinopharm, и 8.33% для Sputnik V.
Из смешанной группы (2 дозы Синофарм, 3- Файзер)-  к "альфе" нейтрализующая активность была у 75%, к "дельте"- у 25%.
Авторы делают вывод, что эффективность вакцин против новых штаммов оказывается не такой высокой, как ожидалось. Титры антител очень сильно варьируют индивидуально и между вакцинами.
За монгольскую волну в июне, ответственна не "дельта", а то, что были рано сняты противоэпидемические меры, тк "альфа" уже была в популяции раньше.
Лучше всего себя показывает  по всем параметрам (защита от пробоев, антитела к шипику, нейтрализующие антитела к вариантам) - мРНК вакцина. Векторные вакцины несколько отстают, а хуже всего результат - у инактивированной.
( Read more... )