Монголы четко подошли
Aug. 13th, 2021 11:09 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
chuka_lisВот, достаточно стройный подход к выяснению причин ситуации с пробоями ковида.
В Монголии (3.3 млн жителей) начали прививать, как и везде, но темпы были не самые быстрые, а и вакцины- всякие.
Случаи ковида росли, потому весной устроили локдаун. Прививать продолжали, так что в мае было уже выше 57% привитых хотя бы 1 дозой в популяции,и 40% полностью,и локдаун вроде бы сработал, все снизилось. Меры сняли. И снова в июне вверх пошли случаи ковида, да как на дрожжах (1-2.5 тыс случаев в день, на пике 3 тыс).
Авторы статьи отмечают, что заболевали как непривитые, так и привитые.
Решив выснить, в чем тут дело (слабо ли работают вакцины и какие, или может устойчивый штамм гуляет), исследователи взяли, да и проверили: что там с антителами у привитых, но не заразившихся (здоровый привитый контроль), ну и, что же за штамм заразил привитых (полная прочитка генома вируса).
Не удивительно, что это был не оригинальный уханьский штамм, а те, что уже гуляли и в других частях мира.
95% пробоев- вариант "альфа" (пошел гулять по миру осенью-зимой). Остальные 5%- вариант "дельта".
Что же по связи случаев пробоев с тем, какой вакциной прививали.
Среди пробоев с вариантом "альфа", 62.1% из пробоев было после прививки Sinopharm, 26.4% после Covishield/AZN, 8.0% после прививки Sputnik V, и 3.4% после прививки Pfizer/BioNTech.
В случае с вариантом "дельта" (5 случаев), 60% после Covishield/AZN, и по 20% из пробоев было после прививки Sinopharm, и Pfizer/BioNTech.
Анализ титров антител к шипиковому белку коронавируса показал, что среди привитых разными вакцинами, больше всего серопозитивность была у привитых Pfizer/BioNTech (91.6%), потом, Covishield/AstraZeneca (70.8%), затем, Sputnik V (29.2%), и в хвосте- Sinopharm (12.5%).
Так же, когда проверили антитела на белок нуклеокапсида у здоровых, "контрольных" привитых, то только у 12% привитых Sinopharm оказались в крови антитела. Это логично (тк только эта вакцина из проверяемых содержит инактивированнй вирус). Обнаружились случаи среди привитых Covishield/AstraZeneca- и, тк вакцины не содержали нуклеокапсидных генов- то был либо асимптоматичный пробой, либо предыдыдущая асимптоматичная инфекция.
Любопытно, что 4 человека получили смешанную прививку- 2 дозы Sinopharm , третья Pfizer/BioNTech. У них обнаружились антитела только к шипику, у 75%.
Сыворотку крови контрольных привитых так же проверили на нейтрализующую активность к вариантам коронавируса "альфа" и "дельта"
У тех, кто был привит Pfizer/BioNTech- нейтрализующий эффект был в 79.7%, для Covishield/AstraZeneca - 50.0%, для Sputnik V нейтрализующая активность для "альфы" была 25.0%, и хуже всех справился Sinopharm (20.8%).
По "дельте" защитный эффект прививки был слабее, и выглядел так: 29.2% - для привитых Pfizer/BioNTech, 25% - для Covishield/AZN, 12,5% для Sinopharm, и 8.33% для Sputnik V.
Из смешанной группы (2 дозы Синофарм, 3- Файзер)- к "альфе" нейтрализующая активность была у 75%, к "дельте"- у 25%.
Авторы делают вывод, что эффективность вакцин против новых штаммов оказывается не такой высокой, как ожидалось. Титры антител очень сильно варьируют индивидуально и между вакцинами.
За монгольскую волну в июне, ответственна не "дельта", а то, что были рано сняты противоэпидемические меры, тк "альфа" уже была в популяции раньше.
Лучше всего себя показывает по всем параметрам (защита от пробоев, антитела к шипику, нейтрализующие антитела к вариантам) - мРНК вакцина. Векторные вакцины несколько отстают, а хуже всего результат - у инактивированной.
A surge in Covid-19 cases in Mongolia in March 2021 resulted in a government-mandated shutdown. This shutdown was relaxed in May 2021 as case numbers decreased and nationwide vaccination rates using Sinopharm, Covishield/AstraZeneca, Sputnik V, and Pfizer/BioNTech vaccines exceeded 50% of the population. Case rates increased again in early June 2021 in both vaccinated and non-vaccinated individuals. To determine whether the surge was due to the emergence of Delta or another variant, or vaccine failure, a rapid, opportunistic investigation was conducted that comprised virus sequence analysis of nasal swab samples from breakthrough cases and antibody assays of plasma from healthy vaccinees. More than 90% of breakthrough infections during the second case surge were due to the Alpha variant. Spike protein ELISA and SARS-CoV-2 neutralization assays data revealed large differences in plasma titers of antibodies to SARS-CoV-2, with mRNA vaccines eliciting higher titers than adenovirus-vectored or killed virus vaccines.
We sequenced 97 nasal samples from Covid-19 patients with breakthrough infections after vaccination, and tested plasma from 100 healthy subjects for antibodies to SARS-CoV-2 (surface glycoprotein, S and nucleocapsid phosphoprotein, NCP), and NAb after Covishield/AstraZeneca, Sputnik V, Sinopharm, or Pfizer/BioNTech vaccination. Full-length SARS-CoV-2 sequences were obtained from 92 samples.
Eighty-seven of 92 (94.6%) were Alpha variant. Five of 92 (5.4%) were Delta variant. Of Alpha 90 variant breakthrough infections, 54 (62.1 %) were from Sinopharm, 7 (8.0%) from Sputnik V, 23 (26.4%) from Covishield/AZN, and 3 (3.4%) from Pfizer/BioNTech vaccinees. Of 5 breakthrough Delta variant infections, 1 (20%) was from Sinopharm, 3 (60%) were from Covishield/AZN, and 1 (20%) was from Pfizer/BioNTech vaccinees.
More subjects had spike ELISA reactivity after Pfizer/BioNTech (91.6%), and Covishield/AstraZeneca (70.8%), than Sputnik V (29.2%) or Sinopharm (12.5%). Nucleoprotein reactivity was present in 12.5% of Sinopharm vaccinees. One Covishield/AstraZeneca vaccinee was NP positive, presumably because of infection. Only Sinopharm contains NP.
Three of four subjects (75%) who received two Sinopharm doses followed by one Pfizer/BioNTech dose were spike-positive.
More subjects had NAb to WA strain after Pfizer/BioNTech (79.7%), and Covishield/AstraZeneca (50.0%), than after Sputnik V (25.0%) or Sinopharm (20.8%).
Neutralizing antibodies to Delta variants were present in fewer subjects after Pfizer/BioNTech (29.2%), Sputnik V (8.33%), and Sinopharm (12.5%). NAb to Delta variants were detected in nine subjects after Covishield/AZN (37.50%); however, 3/9 were NCP ELISA-positive indicating previous SARS-CoV-2 exposure. Eliminating these three subjects would decrease the percentage with NAb to Delta to 25%. Three of four vaccinees who received a single dose of Pfizer/BioNTech after two doses of Sinopharm had NAb to WA; one had NAb to Delta.
В Монголии (3.3 млн жителей) начали прививать, как и везде, но темпы были не самые быстрые, а и вакцины- всякие.
Случаи ковида росли, потому весной устроили локдаун. Прививать продолжали, так что в мае было уже выше 57% привитых хотя бы 1 дозой в популяции,и 40% полностью,и локдаун вроде бы сработал, все снизилось. Меры сняли. И снова в июне вверх пошли случаи ковида, да как на дрожжах (1-2.5 тыс случаев в день, на пике 3 тыс).
Авторы статьи отмечают, что заболевали как непривитые, так и привитые.
Решив выснить, в чем тут дело (слабо ли работают вакцины и какие, или может устойчивый штамм гуляет), исследователи взяли, да и проверили: что там с антителами у привитых, но не заразившихся (здоровый привитый контроль), ну и, что же за штамм заразил привитых (полная прочитка генома вируса).
Не удивительно, что это был не оригинальный уханьский штамм, а те, что уже гуляли и в других частях мира.
95% пробоев- вариант "альфа" (пошел гулять по миру осенью-зимой). Остальные 5%- вариант "дельта".
Что же по связи случаев пробоев с тем, какой вакциной прививали.
Среди пробоев с вариантом "альфа", 62.1% из пробоев было после прививки Sinopharm, 26.4% после Covishield/AZN, 8.0% после прививки Sputnik V, и 3.4% после прививки Pfizer/BioNTech.
В случае с вариантом "дельта" (5 случаев), 60% после Covishield/AZN, и по 20% из пробоев было после прививки Sinopharm, и Pfizer/BioNTech.
Анализ титров антител к шипиковому белку коронавируса показал, что среди привитых разными вакцинами, больше всего серопозитивность была у привитых Pfizer/BioNTech (91.6%), потом, Covishield/AstraZeneca (70.8%), затем, Sputnik V (29.2%), и в хвосте- Sinopharm (12.5%).
Так же, когда проверили антитела на белок нуклеокапсида у здоровых, "контрольных" привитых, то только у 12% привитых Sinopharm оказались в крови антитела. Это логично (тк только эта вакцина из проверяемых содержит инактивированнй вирус). Обнаружились случаи среди привитых Covishield/AstraZeneca- и, тк вакцины не содержали нуклеокапсидных генов- то был либо асимптоматичный пробой, либо предыдыдущая асимптоматичная инфекция.
Любопытно, что 4 человека получили смешанную прививку- 2 дозы Sinopharm , третья Pfizer/BioNTech. У них обнаружились антитела только к шипику, у 75%.
Сыворотку крови контрольных привитых так же проверили на нейтрализующую активность к вариантам коронавируса "альфа" и "дельта"
У тех, кто был привит Pfizer/BioNTech- нейтрализующий эффект был в 79.7%, для Covishield/AstraZeneca - 50.0%, для Sputnik V нейтрализующая активность для "альфы" была 25.0%, и хуже всех справился Sinopharm (20.8%).
По "дельте" защитный эффект прививки был слабее, и выглядел так: 29.2% - для привитых Pfizer/BioNTech, 25% - для Covishield/AZN, 12,5% для Sinopharm, и 8.33% для Sputnik V.
Из смешанной группы (2 дозы Синофарм, 3- Файзер)- к "альфе" нейтрализующая активность была у 75%, к "дельте"- у 25%.
Авторы делают вывод, что эффективность вакцин против новых штаммов оказывается не такой высокой, как ожидалось. Титры антител очень сильно варьируют индивидуально и между вакцинами.
За монгольскую волну в июне, ответственна не "дельта", а то, что были рано сняты противоэпидемические меры, тк "альфа" уже была в популяции раньше.
Лучше всего себя показывает по всем параметрам (защита от пробоев, антитела к шипику, нейтрализующие антитела к вариантам) - мРНК вакцина. Векторные вакцины несколько отстают, а хуже всего результат - у инактивированной.
A surge in Covid-19 cases in Mongolia in March 2021 resulted in a government-mandated shutdown. This shutdown was relaxed in May 2021 as case numbers decreased and nationwide vaccination rates using Sinopharm, Covishield/AstraZeneca, Sputnik V, and Pfizer/BioNTech vaccines exceeded 50% of the population. Case rates increased again in early June 2021 in both vaccinated and non-vaccinated individuals. To determine whether the surge was due to the emergence of Delta or another variant, or vaccine failure, a rapid, opportunistic investigation was conducted that comprised virus sequence analysis of nasal swab samples from breakthrough cases and antibody assays of plasma from healthy vaccinees. More than 90% of breakthrough infections during the second case surge were due to the Alpha variant. Spike protein ELISA and SARS-CoV-2 neutralization assays data revealed large differences in plasma titers of antibodies to SARS-CoV-2, with mRNA vaccines eliciting higher titers than adenovirus-vectored or killed virus vaccines.
We sequenced 97 nasal samples from Covid-19 patients with breakthrough infections after vaccination, and tested plasma from 100 healthy subjects for antibodies to SARS-CoV-2 (surface glycoprotein, S and nucleocapsid phosphoprotein, NCP), and NAb after Covishield/AstraZeneca, Sputnik V, Sinopharm, or Pfizer/BioNTech vaccination. Full-length SARS-CoV-2 sequences were obtained from 92 samples.
Eighty-seven of 92 (94.6%) were Alpha variant. Five of 92 (5.4%) were Delta variant. Of Alpha 90 variant breakthrough infections, 54 (62.1 %) were from Sinopharm, 7 (8.0%) from Sputnik V, 23 (26.4%) from Covishield/AZN, and 3 (3.4%) from Pfizer/BioNTech vaccinees. Of 5 breakthrough Delta variant infections, 1 (20%) was from Sinopharm, 3 (60%) were from Covishield/AZN, and 1 (20%) was from Pfizer/BioNTech vaccinees.
More subjects had spike ELISA reactivity after Pfizer/BioNTech (91.6%), and Covishield/AstraZeneca (70.8%), than Sputnik V (29.2%) or Sinopharm (12.5%). Nucleoprotein reactivity was present in 12.5% of Sinopharm vaccinees. One Covishield/AstraZeneca vaccinee was NP positive, presumably because of infection. Only Sinopharm contains NP.
Three of four subjects (75%) who received two Sinopharm doses followed by one Pfizer/BioNTech dose were spike-positive.
More subjects had NAb to WA strain after Pfizer/BioNTech (79.7%), and Covishield/AstraZeneca (50.0%), than after Sputnik V (25.0%) or Sinopharm (20.8%).
Neutralizing antibodies to Delta variants were present in fewer subjects after Pfizer/BioNTech (29.2%), Sputnik V (8.33%), and Sinopharm (12.5%). NAb to Delta variants were detected in nine subjects after Covishield/AZN (37.50%); however, 3/9 were NCP ELISA-positive indicating previous SARS-CoV-2 exposure. Eliminating these three subjects would decrease the percentage with NAb to Delta to 25%. Three of four vaccinees who received a single dose of Pfizer/BioNTech after two doses of Sinopharm had NAb to WA; one had NAb to Delta.
![[community profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/community.png){kind=small}
no subject
Date: 2021-08-14 06:40 pm (UTC)Монголам тоже благодарна.
no subject
Date: 2021-08-14 08:04 pm (UTC)