Революционная находка
May. 11th, 2021 04:14 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
chuka_lisСтатья о том, что в человеческих клетках геном коронавируса может переводиться в форму ДНК и встраиваться в хозяйскую ДНК, причем во многие места. И не только "на хранение". Но так же и транскрибироваться оттуда обратно в РНК, создавая "химеры" вирусной РНК с человеческими РНК. Авторы считают- что именно это явление ответственно за то, что у ряда людей наблюдается продолжительное (неделями и месяцами) выделение вирусной РНК после выздоровления или даже без болезни. Вирус уних "живет" в латентной форме, встроившись в их ДНК, и выделяя понемногу своей РНК. Хотя обычно на основе таких фрагментов РНК вирусу не удается полноценно "воспроизвестись".
Раньше за такие "вставки", в геном клетки, считалось, были ответственны только ретровирусы (ВИЧ и компания), у которых есть своя обратная транскриптаза. У коронавирусов ее нет, и предполагалось, что им и не нужно (ибо они нарабатываются на уровне РНК) - тем не менее, появились вот такие данные, про интеграцию в ДНК в культуре клеток, и обнаружение "химерных" РНК в тканях переболевших ковидом пациентов..
Если и другие группы найдут или подтвердят нечто похожее- это, на мой взгляд, пролог к открытию, что не только эти вирусы (ретро- и корона-), а вообще многие их семейства- способны на встраивание (при определенных условиях) в геном хозяина- примерно как бактериофаги в геном бактерий. И что горизонтальный перенос генов посредством вирусов между макроорганизмами - гораздо шире, чем представлялось ранее.
Prolonged detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA and recurrence of PCR-positive tests have been widely reported in patients after recovery from COVID-19, but some of these patients do not appear to shed infectious virus. We investigated the possibility that SARS-CoV-2 RNAs can be reverse-transcribed and integrated into the DNA of human cells in culture and that transcription of the integrated sequences might account for some of the positive PCR tests seen in patients. In support of this hypothesis, we found that DNA copies of SARS-CoV-2 sequences can be integrated into the genome of infected human cells. We found target site duplications flanking the viral sequences and consensus LINE1 endonuclease recognition sequences at the integration sites, consistent with a LINE1 retrotransposon-mediated, target-primed reverse transcription and retroposition mechanism. We also found, in some patient-derived tissues, evidence suggesting that a large fraction of the viral sequences is transcribed from integrated DNA copies of viral sequences, generating viral–host chimeric transcripts. The integration and transcription of viral sequences may thus contribute to the detection of viral RNA by PCR in patients after infection and clinical recovery. Because we have detected only subgenomic sequences derived mainly from the 3′ end of the viral genome integrated into the DNA of the host cell, infectious virus cannot be produced from the integrated subgenomic SARS-CoV-2 sequences.
Раньше за такие "вставки", в геном клетки, считалось, были ответственны только ретровирусы (ВИЧ и компания), у которых есть своя обратная транскриптаза. У коронавирусов ее нет, и предполагалось, что им и не нужно (ибо они нарабатываются на уровне РНК) - тем не менее, появились вот такие данные, про интеграцию в ДНК в культуре клеток, и обнаружение "химерных" РНК в тканях переболевших ковидом пациентов..
Если и другие группы найдут или подтвердят нечто похожее- это, на мой взгляд, пролог к открытию, что не только эти вирусы (ретро- и корона-), а вообще многие их семейства- способны на встраивание (при определенных условиях) в геном хозяина- примерно как бактериофаги в геном бактерий. И что горизонтальный перенос генов посредством вирусов между макроорганизмами - гораздо шире, чем представлялось ранее.
Prolonged detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA and recurrence of PCR-positive tests have been widely reported in patients after recovery from COVID-19, but some of these patients do not appear to shed infectious virus. We investigated the possibility that SARS-CoV-2 RNAs can be reverse-transcribed and integrated into the DNA of human cells in culture and that transcription of the integrated sequences might account for some of the positive PCR tests seen in patients. In support of this hypothesis, we found that DNA copies of SARS-CoV-2 sequences can be integrated into the genome of infected human cells. We found target site duplications flanking the viral sequences and consensus LINE1 endonuclease recognition sequences at the integration sites, consistent with a LINE1 retrotransposon-mediated, target-primed reverse transcription and retroposition mechanism. We also found, in some patient-derived tissues, evidence suggesting that a large fraction of the viral sequences is transcribed from integrated DNA copies of viral sequences, generating viral–host chimeric transcripts. The integration and transcription of viral sequences may thus contribute to the detection of viral RNA by PCR in patients after infection and clinical recovery. Because we have detected only subgenomic sequences derived mainly from the 3′ end of the viral genome integrated into the DNA of the host cell, infectious virus cannot be produced from the integrated subgenomic SARS-CoV-2 sequences.
![[community profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/community.png){kind=small}
no subject
Date: 2021-05-12 12:01 am (UTC)Этак мы с домашними животными исторически породнились?
no subject
Date: 2021-05-12 12:23 am (UTC)no subject
Date: 2021-05-12 02:24 am (UTC)no subject
Date: 2021-05-12 04:15 am (UTC)no subject
Date: 2021-05-12 11:03 am (UTC)no subject
Date: 2021-05-12 06:08 pm (UTC)