Референтная сыворотка

[chuka_lis]

Ученые из Айовы решили подойти к определению коррелята защиты  от ковида путем и предложением использования "референтной сыворотки". Цель у них весьма практическая- на случай появления новых вариантов коронавируса, хорошо бы знать, на сколько сформировавшийся после прививок  иммунитет  в популяции (те самые титры антител)- защищают от этого  новичка. Потому что вот была альфа, была дельта, счас вот омикрон.. И новые варианты коронавиурса норовят уходить от иммунного ответа, который сформирован на уханський  штамм, при вакцинации. А имумнитет у привитых  -есть только на него.
В  референтной сыворотке  (как ее готовили- данные в статье) будут известны титры антител- и- используя ее, можно будет видеть, как хорошо она нейтрализует новый вариант вируса, в сравнении со старым. Для выяснения "референтной" нейтрализации использовали критерий: такое разведение "оригинальной" сыворотки, что обеспечивает 90% снижение связывания вируса с АСЕ2 рецептором (или 90% нейтрализацию заражающей способности вируса).
И соответственно, тестируя новый штамм (или псевдовирус  с его шипиком) можно  будет быстро узнавать, на сколько и при каких титрах сохраняется этот нейтрализующий эффект. И, следовательно- на сколько реально защищена привитая популяция от нового варианта.
Так что они создали "пулы" сывороток от привитых разными вакцинами (мРНК, Джансен и экспериментальной, рекомбинантной на основе бакуловируса и наночастиц NVX-CoV2373), и померяли.
Результаты в таблице:

Serum Pool	Days post-final vaccine	Anti-S = anti-spike protein binding antibody, *W.H.O. IU/mL	Anti-Nucleocapsid Ab	RBD = reciprocal of the serum dilution required to reduce receptor binding to ACE-2 by 90%.
Тип вакцины	Время после прививки, дней	Титр антишипиковых антител, IU/mL	Титр к Nбелку	Разведение,  при котором есть 90% нейтрализация связывания вируса с АСЕ2
BNT162b2	69	1,312	0	60
mRNA1273	102	1,447	0	64
Ad26.CoV2373	83	1,936	0	118
NVX-CoV2373	152	587	0	46

Теперь приглашают ВОЗпользоваться их референтной сывороткой.
Идея хорошая. Хотя, конечно, эта референтная сыворотка в ограниченном количестве, и  "не идеальна" (тк все же не может совсем репрезентативно отражать популяционный ответ),  тем не менее, рабочий вариант для приблизительной оценки эффективности защиты.
Еще б таких данных по другим срокам после вакцинации, чтоб можно было ориентироваться, на сколько меняется нейтрализующая способность при других титрах ( тк это 2 разных параметра, она может быть такой же и при более низких титрах, если антител избыточно, или  потому, что антитела к РСЧ (осуществляющие нейтрализацию, преимущественно) - это только часть антител к шипику).
Да, это еще и  в какой то степени ориентир, какие бывают титры в крови анттел после прививок, спустя такие вот сроки.
RNA viruses, including the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), have error-prone polymerases that result in high rates of genome mutation (1, 2). This results in progeny virus genomes that differ from their parental templates, leading to the generation of viral quasispecies within and between individuals (3). SARS-CoV-2 has evolved into variants of concern (VOC) that demonstrate mutations, including the gene that encodes the spike protein that mediates viral entry. These mutations may lead to enhanced transmissibility and new waves of infections (4), as seen most recently Delta (B.1.617.2 and sub-lineages) and Omicron (B.1.1.529) VOC (5, 6). Among VOC, a critical issue is their potential for altered pathogenicity and immune escape from naturally occurring or vaccine-induced antibodies (7). As new SARS-CoV-2 variants emerge, there is an urgent need to understand the relative effectiveness of antibodies elicited by different SARS-CoV-2 vaccines to neutralize VOC replication. Serum is a critical tool for the study of cross-immunity towards naturally occurring SARS-CoV-2 viral variants or model systems such as pseudotyped virus. The availability of reference serum reagents obtained from vaccinated individuals, and produced in volumes large enough to allow distribution, could be used to test for SARS-CoV-2 spike protein binding and neutralization of VOC. This would allow rapid, in vitro characterization of the activity of antibodies elicited by different vaccines against emerging VOC. Further, these can serve as a general reference standard to permit comparison of results and enhance interpretation of study outcomes generated via neutralization and/or spike protein binding antibody assays used by different laboratories across the globe. Here, we report the generation of pooled, large volume reference sera reagents obtained from individuals immunized with one of four COVID-19 vaccines. Donors include recipients of the two SARS-CoV-2 mRNA vaccines (BNT162b2, Pfizer and mRNA-1273, Moderna), a replication-incompetent human adenovirus type 26 vaccine (Ad26.COV2.S, Johnson & Johnson), and a recombinant trimeric spike protein expressed by baculovirus and incorporated into a nanoparticle vaccine plus Matrix-M adjuvant (NVX-CoV2373, Novavax). Donors had no evidence of prior infection and passed screening tests required for blood donation. The pools of reference serum have been aliquoted and are available through BEI Resources (https://www.beiresources.org/Home.aspx). We anticipate the creation of additional sera reference standards, based on vaccination and infection convalescence. The average number of days following the final vaccination dose varied between vaccines: 69 days for BNT162b2, 102 days for mRNA-1273, and 83 days for Ad26.COV2.S recipients. Since NVX-CoV2373 donors had participated in a double blind, placebo controlled, cross over trial, the time of the vaccination was either January and February 2021 or April and May 2021. ..the estimated average time from second NVX-CoV2373 receipt was 152 days
A reference reagent comprised of post-vaccination sera from recipients of different vaccines allows evaluation of in vitro variant neutralization, and provides a reference for comparing assay results across laboratories. We prepared and pooled >1 L serum from donors who received the SARS-CoV-2 mRNA vaccines (BNT162b2, Pfizer and mRNA-1273, Moderna), a replication-incompetent adenovirus type 26 vaccine (Ad26.COV2.S, Johnson and Johnson), or recombinant spike protein expressed by baculovirus incorporated into a nanoparticle vaccine plus Matrix-M adjuvant (NVX-CoV2373, Novavax). Twice frozen sera were aliquoted and are available for distribution to the research community (BEI Resources). The calculated WHO titer of pooled sera to spike protein was 1,312, 1,447, 1,936, and 587 and the reciprocal RBD binding to ACE-2 IC90-titers were 60, 64, 118, and 46 for BNT162b2, mRNA1273, Ad26.CoV2373, and NVX-CoV2373 sera, respectively.