Коронавирусная микроРНК
Sep. 10th, 2021 08:03 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
Как только вирус попадает в клетку, он начинает активность, направленную на подавление иммунитета хозяина. Ведь недостаточный или несвоевременный интерфероновый ответ зачастую обусловливает тяжелое течение ковида, да и других опасных болезней тоже.
Один из механизмов, как показали работы ученых из Йейля и института Пастера- это "угон" вирусом хозяйской системы интерферирующих регуляторных микро РНК- с заменой части хозяйских- вирусными.
Коронавирусные миРНК функционально связываются со специальными белками-аргонавтами, которые присутствует в клетке всегда, и нормально работают. А получившийся комплекс (коронавирусная миРНК-аргонавт) репрессирует определенные гены клетки- именно те, которые относятся к врожденному иммунному ответу. Потому что миРНК является как бы навигатором, показывающим, с чем именно нужно белку-аргонавту связаться, чтоб заблокировать (а то и разрушить) мессенжерную РНК, т.е. считывание\перевод информации с нужного гена. А то и застваить молчать сам ген.
При вирусной атаке клетка "автоматически" запускает сигнальные пути на выработку веществ для борьбы с инфекцией, в частности, интерферона, а эти миРНК-.действуют так, чтоб гены, которые запускают его продукцию- в ответ "молчали".
И это при том, что часто при вирусной инфекции белки-аргноавты именно помогают бороться с инфекцией- их комплексы с микроРНК вируса ингибируют репликацию вируса в клетке (а значит, и производство-выпуск новых вирусных частиц).
Такой вот саботаж от короны.
In this study, we investigated the impact of SARS-CoV-2 infection on host microRNA (miRNA) populations in three human lung-derived cell lines, as well as in nasopharyngeal swabs from SARS-CoV-2 infected individuals. We did not detect any major and consistent differences in host miRNA levels after SARS-CoV-2 infection. However, we unexpectedly discovered a viral miRNA-like small RNA, named vmiR-5p (for viral miRNA), derived from the SARS-CoV-2 ORF7a transcript. Its abundance ranges from low to moderate as compared to host miRNAs. vmiR-5p functionally associates with Argonaute proteins (core components of the RNA interference pathway) leading to downregulation of host transcripts. One such host messenger RNA encodes Basic Leucine Zipper ATF-Like Transcription Factor 2 (BATF2), which is linked to interferon signaling. We demonstrate that vmiR-5p production relies on cellular machinery, yet is independent of Drosha protein, and is enhanced by the presence of a strong and evolutionarily conserved hairpin formed within the ORF7a sequence.
Here, we sequenced small RNAs from SARS-CoV-2-infected human cells and identified a micro RNA (miRNA) encoded in a recently evolved region of the viral genome. We show that the virus-encoded miRNA produces two miRNA isoforms in infected cells by the enzyme Dicer and they are loaded into Argonaute proteins. Moreover, the predominant miRNA isoform targets the 3'UTR of interferon-stimulated genes and represses their expression in a miRNA-like fashion. Finally, the two viral miRNA isoforms were detected in nasopharyngeal swabs from COVID-19 patients. We propose that SARS-CoV-2 employs a virus-encoded miRNA to hijack the host miRNA machinery and evade the interferon-mediated immune response.
Один из механизмов, как показали работы ученых из Йейля и института Пастера- это "угон" вирусом хозяйской системы интерферирующих регуляторных микро РНК- с заменой части хозяйских- вирусными.
Коронавирусные миРНК функционально связываются со специальными белками-аргонавтами, которые присутствует в клетке всегда, и нормально работают. А получившийся комплекс (коронавирусная миРНК-аргонавт) репрессирует определенные гены клетки- именно те, которые относятся к врожденному иммунному ответу. Потому что миРНК является как бы навигатором, показывающим, с чем именно нужно белку-аргонавту связаться, чтоб заблокировать (а то и разрушить) мессенжерную РНК, т.е. считывание\перевод информации с нужного гена. А то и застваить молчать сам ген.
При вирусной атаке клетка "автоматически" запускает сигнальные пути на выработку веществ для борьбы с инфекцией, в частности, интерферона, а эти миРНК-.действуют так, чтоб гены, которые запускают его продукцию- в ответ "молчали".
И это при том, что часто при вирусной инфекции белки-аргноавты именно помогают бороться с инфекцией- их комплексы с микроРНК вируса ингибируют репликацию вируса в клетке (а значит, и производство-выпуск новых вирусных частиц).
Такой вот саботаж от короны.
In this study, we investigated the impact of SARS-CoV-2 infection on host microRNA (miRNA) populations in three human lung-derived cell lines, as well as in nasopharyngeal swabs from SARS-CoV-2 infected individuals. We did not detect any major and consistent differences in host miRNA levels after SARS-CoV-2 infection. However, we unexpectedly discovered a viral miRNA-like small RNA, named vmiR-5p (for viral miRNA), derived from the SARS-CoV-2 ORF7a transcript. Its abundance ranges from low to moderate as compared to host miRNAs. vmiR-5p functionally associates with Argonaute proteins (core components of the RNA interference pathway) leading to downregulation of host transcripts. One such host messenger RNA encodes Basic Leucine Zipper ATF-Like Transcription Factor 2 (BATF2), which is linked to interferon signaling. We demonstrate that vmiR-5p production relies on cellular machinery, yet is independent of Drosha protein, and is enhanced by the presence of a strong and evolutionarily conserved hairpin formed within the ORF7a sequence.
Here, we sequenced small RNAs from SARS-CoV-2-infected human cells and identified a micro RNA (miRNA) encoded in a recently evolved region of the viral genome. We show that the virus-encoded miRNA produces two miRNA isoforms in infected cells by the enzyme Dicer and they are loaded into Argonaute proteins. Moreover, the predominant miRNA isoform targets the 3'UTR of interferon-stimulated genes and represses their expression in a miRNA-like fashion. Finally, the two viral miRNA isoforms were detected in nasopharyngeal swabs from COVID-19 patients. We propose that SARS-CoV-2 employs a virus-encoded miRNA to hijack the host miRNA machinery and evade the interferon-mediated immune response.
no subject
Date: 2021-09-11 12:32 pm (UTC)no subject
Date: 2021-09-12 12:54 am (UTC)