Реконструкция ковидных волн- Исландия.
Jun. 17th, 2021 07:49 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
chuka_lisИсланды выпустили интересный препринт.
Тк у них случаев мало, а мер много, то они отследили: что, кто, когда, откуда.
И показали,что соблюдение карантина оставляет 11% шанс вирусу распрострраниться, однако, если тестировать, отслеживать контакты, продолжать карантинить и ограничивать социализирование, результат не заставит себя ждать- эпидемия сойдет на нет- как у них в мае (первая волна). Вторая и третья к ним пришли почти одновременно, летом с небольшим разрывом- завезенные снаружи (откуда еще) -причем третья- самая массивная, половина их случаев. За 89% случаев ковида третьей волны ответственен всего 1 человек, привезший вирус в страну в августе 2020 года. Тк они трейсили и секвенировали геномы, то могли видеть, как растет это" дерево" заражений.
Интересно, что среди исландцев асимптоматичных было всего 7% (симптомы не появились до теста и вов ермя карантина). При этом на момент теста симптмоатичными были 69%. Значит, примерно 24% были асимптоматичны всего лишь на время теста, потом вирус берет свое. При этом, у них особо тяжело никто не болел.
Так же, оказалось, что чем быстрее человек получит тест после "контакта" и уйдет на карантин (даже без теста)- тем меньше его шансы передать вирус дальше (закономерно, да?) - они подтвердили это математически.
Авторы считают, что в первую волну они отследили 56% случаев болезни в стране, а в 3ю -уже 70-87%. Часть из недиагностированных все равно попала под карантинные меры и не смогла распространять вирус.
Еще исландцы расчитали, что дети были примерно в 2 раза реже источниками заразы, чем взрослые. Особенно хорошо передавали вирус взрослые "рабочего возраста" (от 16 лет и до 66 лет). Потому люди работоспособного возраста- ключевые в распространении вируса, и их желательно прививать поскорее.
Логично, что заразу распространяют те, кто больше двигается и меньше соблюдает карантин. И если дети находятся под влиянием родителей и снижают контактность, а старики сами боятся и сидят дома- то конечно основное "бремя" распространения заразы ложится на плечи трудоспособного и активного населения, особенно если оно не склонно ограничиваться, тестироваться и отчитываться, с кем контактировало.
Vaccinations against SARS-CoV-2 were initiated in Iceland on December 28th, 2020 and when the last blue clade case was diagnosed on January 28th, 2021, only 3.6% of the adult population (16 years and older) had received at least one vaccine dose. The success of the containment was largely due to non-pharmaceutical interventions, mass testing and effective contact tracing measures.Although the third wave continued past December 1st, this dataset contains 91% of the 2783 persons who were ever diagnosed with this clade.
The number persons symptomatic upon diagnosis was 1738 (69%) and 187 (7%) never showed any symptoms at all.
Persons diagnosed after a short quarantine, i.e. one or two days, were 66.6% more infectious (95%-CI: 49.3%-85.2%, p=4.0×10−19) than those diagnosed after a long quarantine, i.e. three or more days, with an
of 0.89 (95%-CI: 0.83-0.96) and 0.54 (95%-CI: 0.50-0.58), respectively. This indicates that the sooner people were quarantined after exposure, the fewer opportunities they had to infect others, which in turn shows that contact tracing is highly time critical. Additionally, those diagnosed outside quarantine were 144.4% more infectious (95%-CI: 116.8%-174.1%, p=2.5×10−50) than those who were diagnosed after a long quarantine.
We found that mandated quarantine significantly decreased the spread of the third wave of SARS-CoV-2 infections in Iceland, with persons diagnosed outside of quarantine being 89% more infectious than those diagnosed while in quarantine. Furthermore, we observed that contact tracing is time critical, by comparing the infectiousness of people diagnosed after one or two days in quarantine to that of those diagnosed after three or more days in quarantine. Lastly, we found that people of working age played a key role in the generation of the third wave in Iceland.
We found that vaccinating persons in ascending order of age or uniformly at random would have prevented more
transmissions per vaccination than vaccinating in descending order of age, in the third wave of SARS-CoV-2 infections in Iceland.
Vaccinating the remaining adult population uniformly at random is a more robust strategy, since it removes the dependency between who is vaccinated and their age.The third wave in Iceland was contained using non-pharmaceutical interventions, primarily contact tracing, quarantine, and social restrictions.
Тк у них случаев мало, а мер много, то они отследили: что, кто, когда, откуда.
И показали,что соблюдение карантина оставляет 11% шанс вирусу распрострраниться, однако, если тестировать, отслеживать контакты, продолжать карантинить и ограничивать социализирование, результат не заставит себя ждать- эпидемия сойдет на нет- как у них в мае (первая волна). Вторая и третья к ним пришли почти одновременно, летом с небольшим разрывом- завезенные снаружи (откуда еще) -причем третья- самая массивная, половина их случаев. За 89% случаев ковида третьей волны ответственен всего 1 человек, привезший вирус в страну в августе 2020 года. Тк они трейсили и секвенировали геномы, то могли видеть, как растет это" дерево" заражений.
Интересно, что среди исландцев асимптоматичных было всего 7% (симптомы не появились до теста и вов ермя карантина). При этом на момент теста симптмоатичными были 69%. Значит, примерно 24% были асимптоматичны всего лишь на время теста, потом вирус берет свое. При этом, у них особо тяжело никто не болел.
Так же, оказалось, что чем быстрее человек получит тест после "контакта" и уйдет на карантин (даже без теста)- тем меньше его шансы передать вирус дальше (закономерно, да?) - они подтвердили это математически.
Авторы считают, что в первую волну они отследили 56% случаев болезни в стране, а в 3ю -уже 70-87%. Часть из недиагностированных все равно попала под карантинные меры и не смогла распространять вирус.
Еще исландцы расчитали, что дети были примерно в 2 раза реже источниками заразы, чем взрослые. Особенно хорошо передавали вирус взрослые "рабочего возраста" (от 16 лет и до 66 лет). Потому люди работоспособного возраста- ключевые в распространении вируса, и их желательно прививать поскорее.
Логично, что заразу распространяют те, кто больше двигается и меньше соблюдает карантин. И если дети находятся под влиянием родителей и снижают контактность, а старики сами боятся и сидят дома- то конечно основное "бремя" распространения заразы ложится на плечи трудоспособного и активного населения, особенно если оно не склонно ограничиваться, тестироваться и отчитываться, с кем контактировало.
Vaccinations against SARS-CoV-2 were initiated in Iceland on December 28th, 2020 and when the last blue clade case was diagnosed on January 28th, 2021, only 3.6% of the adult population (16 years and older) had received at least one vaccine dose. The success of the containment was largely due to non-pharmaceutical interventions, mass testing and effective contact tracing measures.Although the third wave continued past December 1st, this dataset contains 91% of the 2783 persons who were ever diagnosed with this clade.
The number persons symptomatic upon diagnosis was 1738 (69%) and 187 (7%) never showed any symptoms at all.
Persons diagnosed after a short quarantine, i.e. one or two days, were 66.6% more infectious (95%-CI: 49.3%-85.2%, p=4.0×10−19) than those diagnosed after a long quarantine, i.e. three or more days, with an
of 0.89 (95%-CI: 0.83-0.96) and 0.54 (95%-CI: 0.50-0.58), respectively. This indicates that the sooner people were quarantined after exposure, the fewer opportunities they had to infect others, which in turn shows that contact tracing is highly time critical. Additionally, those diagnosed outside quarantine were 144.4% more infectious (95%-CI: 116.8%-174.1%, p=2.5×10−50) than those who were diagnosed after a long quarantine.We found that mandated quarantine significantly decreased the spread of the third wave of SARS-CoV-2 infections in Iceland, with persons diagnosed outside of quarantine being 89% more infectious than those diagnosed while in quarantine. Furthermore, we observed that contact tracing is time critical, by comparing the infectiousness of people diagnosed after one or two days in quarantine to that of those diagnosed after three or more days in quarantine. Lastly, we found that people of working age played a key role in the generation of the third wave in Iceland.
We found that vaccinating persons in ascending order of age or uniformly at random would have prevented more
transmissions per vaccination than vaccinating in descending order of age, in the third wave of SARS-CoV-2 infections in Iceland.
Vaccinating the remaining adult population uniformly at random is a more robust strategy, since it removes the dependency between who is vaccinated and their age.The third wave in Iceland was contained using non-pharmaceutical interventions, primarily contact tracing, quarantine, and social restrictions.
![[community profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/community.png){kind=small}