![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
Омикрон за омикроном
Feb. 22nd, 2022 06:03 pmВ Дании провели исследование, поставившее целью определить возможность заражения омикроном2 после обычного омикрона, в короткий промежуток времени.
Омикронов есть несколько вариантов, сейчас доминирует везде первый, который и называют "омикроном", но есть еще и BA.1.1, BA.2 (омикрон-2) и BA.3.
Омикрон и омикрон2 отличаются 40 мутациями (это прилично), часть из которых в РСЧ, и некоторые- в других важных иммуногенных областях, и иммунный ответ на эти варианты может не совпадать.
Дания с начала омикроновой волны конкретно переболела омикроном, несмотря на высокую привитость популяции (81% получили 2 дозы вакцины, 62% - с бустером): с 21 ноября по 11 февраля, ковид подхватили более 1.8 млн человек, или 32% популяции страны. Омикрон начал очень быстро доминировать, но вскорости за ним в Дании, одной из первых еврпейских стран, появился и омикрон-2, который, с начала 2022 года так распространился, что на средину февраля был ответственен за 88% новых случаев ковида в стране.
Тк тестируют в Дании бесплатно и местами даже обязательно (если обратился в больницу, с другим поводом, или на операцию, итп, все равно сделают тест на ковид), и, так же, делают периодически полный сиквенс генома вируса, то, наблюдая картину высокой заболеваемости и реинфекций (особенно в районе Копенгагена), авторы смогли сделать выборку по случаям, когда новый ковид случился в период межуд 20 и 60 днями после предыдущего, к тому же вирусного материала было достаточно, и, так же, был проведен анализ генома достаточного качества.
Полный сиквенс, разумеется, там делают не всегда, а только примерно в каждом 15 случае, к тому же, для исследования надо было, чтобы были "пары" (и первый и второй полный сиквенс), но у них все же набралось из примерно 1700 реинфекций за этот период, из них примерно 470 удовлетворяющих случаев, которые они рандомно выбрали, по их критериям. Дальше чуток подсократилось (до 273 пар из которых только 187 качественных), тк достаточно качественный материал в мазках был не всегда.
Часть из пар была: омикрон после дельты, омикрон-2 после дельты, омикрон после омикрона, но нашлось и 47 пар, когда первый ковид за это время был омикрон, а второй- омикрон-2 (18% пар).
Авторы отмечают, что все случаи заболевания омикроном2 после омикрона были умеренные и легкие, никто не нуждался в госпитализации или не умер. 70% из этих случаев- молодые люди, до 20 лет. Медианный возраст 15 лет. Из них привитых было только 13%.
Омикроном (первый ковид) они так же болели легко или умеренно. Средняя симптоматичная продолжительность обоих ковидов была 4 дня. Такая же она была, если подхватывали омикрон после омикрона. Касательно этого варианта "пары"- то в основном, авторы склоняются к мысли, что это была не новая инфекция, а все еще старый вирус, тк в большинстве случаев было мало генетических отличий между 1м и 2 образцом омикрона, и период выяления "второго омикронового ковида" был короче (чем для пары "омикрон-омикрон2") - в среднем, 26 дней.
Второй омикроновый ковид вскорости после 1го, таким оразом, переносился в общем и целом средне и легко. Кроме того, вируса при втором ковиде (был ли это омикрон или омикрон2) выделялось меньше чем при первом, впрочем, все попадало в разброс выделения омикрона и омикрона2 по популяции ( при 1м ковиде).
С одной стороны, авторы удивлены, что реинфекции спустя короткое время случаются именно с молодежью- ведь по предположениям, считается, что иммунный ответ на ковид у молодых более качественный и многовариантный, потому они должны бы быть лучше защищены от реинфекции, даже и другим штаммом, тем более спустя такое короткое время.
Так же, авторы поднимают вопрос- не смотря на то, что случаев реинфекций омикрон-омикрон-2 мало, все же это 2 разные линии вируса (как и дельта-омикрон или дельта-омикрон2), и точно реинфекции, и все они случились до 60 дней после 1 ковида. В то время как сейчас реинфекцией называют и считают только те случаи ковида, когда второй раз ковид случился спустя не менее 60 дней.
Возможно, критерий реинфекции в случае ковида стоит пересмотреть.
( Read more... )
Омикронов есть несколько вариантов, сейчас доминирует везде первый, который и называют "омикроном", но есть еще и BA.1.1, BA.2 (омикрон-2) и BA.3.
Омикрон и омикрон2 отличаются 40 мутациями (это прилично), часть из которых в РСЧ, и некоторые- в других важных иммуногенных областях, и иммунный ответ на эти варианты может не совпадать.
Дания с начала омикроновой волны конкретно переболела омикроном, несмотря на высокую привитость популяции (81% получили 2 дозы вакцины, 62% - с бустером): с 21 ноября по 11 февраля, ковид подхватили более 1.8 млн человек, или 32% популяции страны. Омикрон начал очень быстро доминировать, но вскорости за ним в Дании, одной из первых еврпейских стран, появился и омикрон-2, который, с начала 2022 года так распространился, что на средину февраля был ответственен за 88% новых случаев ковида в стране.
Тк тестируют в Дании бесплатно и местами даже обязательно (если обратился в больницу, с другим поводом, или на операцию, итп, все равно сделают тест на ковид), и, так же, делают периодически полный сиквенс генома вируса, то, наблюдая картину высокой заболеваемости и реинфекций (особенно в районе Копенгагена), авторы смогли сделать выборку по случаям, когда новый ковид случился в период межуд 20 и 60 днями после предыдущего, к тому же вирусного материала было достаточно, и, так же, был проведен анализ генома достаточного качества.
Полный сиквенс, разумеется, там делают не всегда, а только примерно в каждом 15 случае, к тому же, для исследования надо было, чтобы были "пары" (и первый и второй полный сиквенс), но у них все же набралось из примерно 1700 реинфекций за этот период, из них примерно 470 удовлетворяющих случаев, которые они рандомно выбрали, по их критериям. Дальше чуток подсократилось (до 273 пар из которых только 187 качественных), тк достаточно качественный материал в мазках был не всегда.
Часть из пар была: омикрон после дельты, омикрон-2 после дельты, омикрон после омикрона, но нашлось и 47 пар, когда первый ковид за это время был омикрон, а второй- омикрон-2 (18% пар).
Авторы отмечают, что все случаи заболевания омикроном2 после омикрона были умеренные и легкие, никто не нуждался в госпитализации или не умер. 70% из этих случаев- молодые люди, до 20 лет. Медианный возраст 15 лет. Из них привитых было только 13%.
Омикроном (первый ковид) они так же болели легко или умеренно. Средняя симптоматичная продолжительность обоих ковидов была 4 дня. Такая же она была, если подхватывали омикрон после омикрона. Касательно этого варианта "пары"- то в основном, авторы склоняются к мысли, что это была не новая инфекция, а все еще старый вирус, тк в большинстве случаев было мало генетических отличий между 1м и 2 образцом омикрона, и период выяления "второго омикронового ковида" был короче (чем для пары "омикрон-омикрон2") - в среднем, 26 дней.
Второй омикроновый ковид вскорости после 1го, таким оразом, переносился в общем и целом средне и легко. Кроме того, вируса при втором ковиде (был ли это омикрон или омикрон2) выделялось меньше чем при первом, впрочем, все попадало в разброс выделения омикрона и омикрона2 по популяции ( при 1м ковиде).
С одной стороны, авторы удивлены, что реинфекции спустя короткое время случаются именно с молодежью- ведь по предположениям, считается, что иммунный ответ на ковид у молодых более качественный и многовариантный, потому они должны бы быть лучше защищены от реинфекции, даже и другим штаммом, тем более спустя такое короткое время.
Так же, авторы поднимают вопрос- не смотря на то, что случаев реинфекций омикрон-омикрон-2 мало, все же это 2 разные линии вируса (как и дельта-омикрон или дельта-омикрон2), и точно реинфекции, и все они случились до 60 дней после 1 ковида. В то время как сейчас реинфекцией называют и считают только те случаи ковида, когда второй раз ковид случился спустя не менее 60 дней.
Возможно, критерий реинфекции в случае ковида стоит пересмотреть.
( Read more... )
![[community profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/community.png){kind=small}