Ученые из Вашингтона изучали ситуацию со вспышкой ковида
на рыболовецком судне в мае 2020 года. Команда судна- 122 человека, большинство из которых согласились провериться: 120 сделали тест на ковид (ПЦР и антитела) перед тем как корабль отправился в океан. Все 120 мазков (из носа) были отрицательными, антитела были у 3 человек (но они не были больны по тогдашним критериям ковида, и мазки у них были тоже отрицательные).
К сожалению, через 16 дней корабль уже был на карантине в порту, тк заболело много моряков, работать некому, пришлось вернуться; и в концу вспышки ковидом переболело около 80% команды.
Исследователи имели возможность брать у них мазки (пока все были "на карантине" или лечении) неоднократно, потому воспользовались случаем, и провели усиленный анализ генома на мутации, у тех, у кого позволяло количество вируса (39 человек, у которых было много вируса, менее 26 циклов ПЦР, на момент возвращения в порт). Авторы пришли к выводу, что на судне случилось "суперраспространение" с высоким коэффициентом передачи (атаки), тк все выявленные варианты были ближайшими родственниками. Точнее, они практически не отличались друг от друга.
Теоретически, вирус может мутировать в любое время, и выгодные для него мутации- закрепляются. За время болезни в одном человек вирус "выращивает" целую цивилизацию себе подобных, десятки поколений, часть из которых может отличаться от "предков". И кто из них передастся дальше, и даст следующее поколение вирусов в другом хозяине- это тот еще вопрос.
Согласно полученным данным, вирус мутирует слабо, медленно, за время жизни в одном хозяине (при обычном, кратковременном течениии ковида). Этом может быть 5% выделяемых вирусов, у которых 1-2 мутации на геном, к исходу ковида.
Это не так уж много.
Так что эволюция у вируса просиходит, преимущественно, не внутри одного хозяина, а стимулируется "сменой хозяев" (тк получается новая среда, к которой надо приспосабливаться, а удачная мутация- закрепится). Для того, чтобы коронавирус хорошо мутировал, ему нужна высокая частота передачи между хозяевами (тк бутылочное горлышко для него "узкое"), а остальное он обеспечивает уже сам, своей высокой заразностью (тк большинство инфекций и их массовость - это из-за "суперраспространений").
От меня:
Не то чтобы это новость, но их работа просто намекает, что если люди хотят болеть ковидом поменьше, особенно новыми штаммами- то распространение вируса нужно прерывать, ограничивать всеми способами. В противном случае из-за частоты передачи и массовости заражений даже слабомутирующий (относительно) вирус, будет иметь довольно высокое абсолютное количество мутаций за более короткий период времени. Больше мутаций- больше биологических отличий ( в свойствах).
Вирус просто живет, и выживает, а люди ему не особо препятствуют. Не случайно в первый год эпидемии, когда нефармакологические противоэпидемические меры были более широко распространены и даже беспрецедентны, новых вариантов, достаточных измененных, чтоб называться штаммами, было не так уж много, и обычно появлялись они там, где хуже соблюдались меры (слабые законодательные или исполнительные возможности). С упованием на вакцинацию как ограничительную и противоэпидемическую меру (популяционный иммунитет), преимущественно, новые варианты посыпались, как из рога изобилия (относительно возможностей вируса). И этот процесс продолжается, и думаю, будет продолжаться, тк и привитость среди народов и стран- варьирует, и иммунитет к ковиду- кратковременный (не стоит закрывать на это глаза), и к тому же прививка не особо мешает заражению..
( Read more... )