Обзорная
работа,в "стандартизационном" направлении.
В настоящее время заражаемость чувствительных клеточных культур является наиболее точным методом демонстрации жизнеспособности и инфекционности коронавируса SARS–2.
Однако рутинная клиническая диагностика в основном выполняется с помощью анализов на основе ПЦР, где определяется положительность или отрицательность по заданному порогу циклов, и такие тонкости как количество вируса, а тем более инфекционность, недоступны.
Авторы задались целью найти корреляцию между количеством циклов, количеством вируса, и инфекционностью вируса. для чего провели обзорный анализ 540 статей (с данными про мазки, образцы выделений организма, ПЦР и посевы, от больных, с калибровочными экспериментами для разных методов количественной оценки, и эксперименты)
Оказалось, что у тех, кто болел легко и средне, после 10 дня вирус уже не культивировался у 99%, хотя выделялся до 67 дней. Если Ct выше 30, то только 11% из таких мазков все еще оставались заразными, а при Ct> 35 культуры почти всегда вирусом заражать не получалось.
У тяжело больных, или у иммунокомпромиссных, однако, вирус культивировался до 32 дней (у 19%).
Если у пациента ПЦР показывал положительность Ct> 35, или минимальное рассчитанное количество копий вирусного генома в образце составляло 2,5 × 10(3) копий/мл, то культуру вируса получать уже не удавалось.
Из образцов выделений орагнизма (грудное молоко, слезы, стул, моча) иногда, но непредсказуемо, исследователям удавалось получать посевы вируса (те не респираторные выделения могли быть заразными).
Преобразование значений Ct в копии вирусного генома показало вариабельность между различными анализами ПЦР и подчеркнуло необходимость стандартизации отчетов для правильного сравнения результатов, полученных в разных лабораториях. Так что, с точки зрения авторов, исходя из данных их анализа, во время фазы пандемии пациенты с нетяжелым COVID-19, без иммуносупрессии, могут считаться практически незаразными после 10 дней с момента появления симптомов, или, со значением Ct выше 35. Так же и для асимптоматичных, если у них Ct> 35.